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科學(xué)家實現(xiàn)全腦光學(xué)接口虛擬現(xiàn)實和全腦閉環(huán)研究新范式
來源:自動化研究所 腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心 發(fā)表于 2024/3/27

中國科學(xué)院自動化研究所蒿杰研究組聯(lián)合腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心杜久林研究組與穆宇研究組,開發(fā)出一套實感智能計算-控制平臺,可快速提取和分析斑馬魚全腦神經(jīng)元活動,實現(xiàn)神經(jīng)元集群活動的閉環(huán)調(diào)控。3月11日,相關(guān)研究成果以Real-time analysis of large-scale neuronal imaging enables closed-loop investigation of neural dynamics為題,在線發(fā)表在《自然-神經(jīng)科學(xué)》(Nature Neuroscience)上。 


該研究借助天文學(xué)領(lǐng)域的數(shù)據(jù)處理技術(shù),采用FPGA-GPU混合架構(gòu),對高達500MB/s的大數(shù)據(jù)流神經(jīng)功能數(shù)據(jù)進行實時配準(zhǔn)、信號提取和分析。該研究實現(xiàn)了對斑馬魚全腦十萬級神經(jīng)元的實時監(jiān)控,進而解碼任意選擇的神經(jīng)元集群活動,以控制外部設(shè)備。這標(biāo)志著基于全腦單細胞光學(xué)成像的虛擬現(xiàn)實、光遺傳調(diào)控等技術(shù)在腦科學(xué)閉環(huán)研究領(lǐng)域的應(yīng)用邁出了關(guān)鍵一步。       


全腦范圍單神經(jīng)元活動成像是解析大腦并行分布式計算原理的工具,但較大數(shù)據(jù)實時處理需求成為技術(shù)發(fā)展的瓶頸,導(dǎo)致難以實時分析以及在大尺度上閉環(huán)調(diào)控和研究腦功能。受到天文學(xué)領(lǐng)域中的快速射電暴檢測技術(shù)的啟發(fā),科研人員借鑒系統(tǒng)設(shè)計策略,利用FPGA編程的靈活性建立光學(xué)神經(jīng)信號預(yù)處理系統(tǒng),對來自光學(xué)傳感器的信號規(guī)整化,并發(fā)送到基于GPU的實時處理系統(tǒng),進行高速非線性配準(zhǔn),提取各信道的神經(jīng)信號,依據(jù)編碼規(guī)則進行解碼,以獲得用于控制外部器件的反饋信號。該系統(tǒng)通過實時監(jiān)測斑馬魚全腦神經(jīng)元的活動,生成反饋信號(反饋間隔小于70.5毫秒)。       


實感智能計算-控制平臺的性能在三個腦科學(xué)閉環(huán)研究場景下得到展示,即與任意特定神經(jīng)元集群活動鎖相的實時光遺傳學(xué)刺激,與特定大腦功能狀態(tài)鎖相的實時視覺刺激,以及基于神經(jīng)元集群活動的虛擬現(xiàn)實控制。      


在閉環(huán)實時光遺傳學(xué)神經(jīng)調(diào)控方面,研究通過功能聚類識別全腦神經(jīng)元集群,將選定集群的自發(fā)活動作為觸發(fā)信號,實施實時光遺傳學(xué)刺激于目標(biāo)神經(jīng)元集群。相對于開環(huán),閉環(huán)刺激有效激活了下游腦區(qū)。       


在鎖相的實時視覺刺激實驗方面,研究通過實時監(jiān)測藍斑去甲腎上腺素能系統(tǒng)活動,在表征動物清醒狀態(tài)的藍斑興奮時相上施加視覺刺激,觀察到大腦中其他神經(jīng)元的反應(yīng)更為強烈。這表明大腦狀態(tài)可調(diào)節(jié)視覺信息的處理,并提出閉環(huán)感覺刺激有助于探討大腦內(nèi)部狀態(tài)與外界環(huán)境的相互作用。


在全腦光學(xué)腦機接口實現(xiàn)的虛擬現(xiàn)實方面,研究實時將高維的全腦所有神經(jīng)元活動降維到多個神經(jīng)元集群的活動,并將任一集群的活動與視覺環(huán)境閉環(huán)聯(lián)接,建立了基于光學(xué)成像、直接從腦神經(jīng)活動到視覺環(huán)境的虛擬現(xiàn)實系統(tǒng)。這一虛擬現(xiàn)實中,可以隨意調(diào)整神經(jīng)活動與環(huán)境耦合的增益,使控制環(huán)境的神經(jīng)元集群根據(jù)增益變化適應(yīng)性地調(diào)整輸出。


研究工作得到科學(xué)技術(shù)部、國家自然科學(xué)基金委員會、中國科學(xué)院、上海市和深圳市的支持。相關(guān)成果已被授權(quán)發(fā)明專利“光學(xué)腦機接口系統(tǒng)和方法”。


論文鏈接 https://www.nature.com/articles/s41593-024-01595-6

概念圖:借鑒天文數(shù)據(jù)處理體系搭建的實時處理系統(tǒng)可提取和解析斑馬魚全腦的神經(jīng)元活動,展現(xiàn)了這一系統(tǒng)如何將內(nèi)在世界的神經(jīng)活動與外部現(xiàn)實世界連接起來的迷人之處。     

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